Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnft1Q9DCN7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnft1Q9DCN7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms