Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Syvn1Q9DBY1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms