Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ift43Q9DA69 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ift43Q9DA69 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms