Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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Tmem239Q9DA47 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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Tmem239Q9DA47 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Tmem239Q9DA47 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem239Q9DA47 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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