Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smco2Q9DA21 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smco2Q9DA21 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms