Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn22Q9D7U6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn22Q9D7U6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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