Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmigd1Q9D7L8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms