Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q9D7E4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms