Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PudpQ9D5U5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PudpQ9D5U5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PudpQ9D5U5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PudpQ9D5U5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PudpQ9D5U5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PudpQ9D5U5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PudpQ9D5U5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PudpQ9D5U5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms