Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ribc2Q9D4Q1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms