Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc6Q9D4E6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms