Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sohlh2Q9D489 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sohlh2Q9D489 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sohlh2Q9D489 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh2Q9D489 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh2Q9D489 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh2Q9D489 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sohlh2Q9D489 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sohlh2Q9D489 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sohlh2Q9D489 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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