Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx29Q9D3S3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx29Q9D3S3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx29Q9D3S3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx29Q9D3S3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snx29Q9D3S3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx29Q9D3S3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx29Q9D3S3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx29Q9D3S3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx29Q9D3S3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx29Q9D3S3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx29Q9D3S3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms