Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy3Q9D394 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242 ms