Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem88Q9D0N8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms