Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CYI0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms