Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
ChtopQ9CY57 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
ChtopQ9CY57 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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