Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
RpainQ9CWY9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms