Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nup37Q9CWU9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms