Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rprd1bQ9CSU0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rprd1bQ9CSU0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rprd1bQ9CSU0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rprd1bQ9CSU0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms