Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Mrpl35Q9CQL6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Mrpl35Q9CQL6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Mrpl35Q9CQL6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Mrpl35Q9CQL6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mrpl35Q9CQL6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Mrpl35Q9CQL6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mrpl35Q9CQL6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms