Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccer1Q9CQL2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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