Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chmp3Q9CQ10 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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