Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Prpf8Q99PV0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms