Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nup155Q99P88 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms