Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Hdac9Q99N13 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Hdac9Q99N13 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Hdac9Q99N13 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac9Q99N13 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hdac9Q99N13 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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