Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tdrd1Q99MV1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tdrd1Q99MV1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tdrd1Q99MV1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tdrd1Q99MV1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms