Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atp1b4Q99ME6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms