Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cstf3Q99LI7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms