Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RtcbQ99LF4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RtcbQ99LF4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RtcbQ99LF4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RtcbQ99LF4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RtcbQ99LF4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RtcbQ99LF4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RtcbQ99LF4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RtcbQ99LF4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms