Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmp1Q99KU0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms