Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ciao1Q99KN2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ciao1Q99KN2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms