Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Higd1bQ99JY6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Higd1bQ99JY6 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms