Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pacsin3Q99JB8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pacsin3Q99JB8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms