Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tspan1Q99J59 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms