Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Cldn16Q925N4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Cldn16Q925N4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cldn16Q925N4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cldn16Q925N4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cldn16Q925N4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cldn16Q925N4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cldn16Q925N4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cldn16Q925N4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Cldn16Q925N4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms