Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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