Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Smc1bQ920F6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Smc1bQ920F6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smc1bQ920F6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Smc1bQ920F6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Smc1bQ920F6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Smc1bQ920F6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Smc1bQ920F6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Smc1bQ920F6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Smc1bQ920F6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smc1bQ920F6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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