Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atl3Q91YH5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms