Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppargc1bQ8VHJ7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms