Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nup58Q8R332 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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