Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vmn1r200Q8R281 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Vmn1r200Q8R281 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Vmn1r200Q8R281 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Vmn1r200Q8R281 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Vmn1r200Q8R281 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Vmn1r200Q8R281 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Vmn1r200Q8R281 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Vmn1r200Q8R281 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Vmn1r200Q8R281 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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