Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Colec12Q8K4Q8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms