Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hecw1Q8K4P8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms