Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MyripQ8K3I4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms