Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc12Q8K2L8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc12Q8K2L8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms