Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcho1Q8K285 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms