Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cd300eQ8K249 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cd300eQ8K249 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cd300eQ8K249 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cd300eQ8K249 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cd300eQ8K249 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cd300eQ8K249 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cd300eQ8K249 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cd300eQ8K249 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms