Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Nek9Q8K1R7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek9Q8K1R7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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