Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LgsnQ8CIX8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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LgsnQ8CIX8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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LgsnQ8CIX8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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LgsnQ8CIX8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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LgsnQ8CIX8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LgsnQ8CIX8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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